消毒是水處理工藝的重要組成部分。隨著城市的發展和人居環境質量要求的提高，城市供水的安全性、供水系統的優化以及污水處理廠出水的安全問題引起了人們的廣泛關注。特別是2003年非典性肺炎的突然爆發，使人們充分認識到控制城市生活污水中致病性傳染微生物是污水處理的重要內容。城市污水經過二級處理后，水質改善，細菌含量大幅度減少，但細菌的絕對值仍很客觀，并存在病原菌的可能，為防止對人類健康產生危害和對生態造成污染，在污水排入水體前應進行消毒處理，目前城市污水處理廠中最常用的消毒劑仍為液氯、次氯酸鈉、二氧化氯和臭氧。

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